MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 112404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_003552	ATTG	2	8	235445	235452	25 %	50 %	25 %	0 %	20089093
4502	NC_003552	TGA	2	6	235455	235460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089093
4503	NC_003552	CAT	2	6	235540	235545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089093
4504	NC_003552	CTG	2	6	235572	235577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089093
4505	NC_003552	CAA	2	6	235578	235583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089093
4506	NC_003552	GGGTTC	2	12	235588	235599	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	20089093
4507	NC_003552	CCG	2	6	235715	235720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20089093
4508	NC_003552	GTCC	2	8	235746	235753	0 %	25 %	25 %	50 %	20089093
4509	NC_003552	TGGGG	2	10	235805	235814	0 %	20 %	80 %	0 %	20089093
4510	NC_003552	T	6	6	235829	235834	0 %	100 %	0 %	0 %	20089093
4511	NC_003552	TCT	3	9	235901	235909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089093
4512	NC_003552	A	6	6	235929	235934	100 %	0 %	0 %	0 %	20089093
4513	NC_003552	TTC	2	6	236048	236053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089093
4514	NC_003552	CTG	2	6	236086	236091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089093
4515	NC_003552	A	6	6	236095	236100	100 %	0 %	0 %	0 %	20089093
4516	NC_003552	TAG	2	6	236268	236273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089093
4517	NC_003552	AGG	2	6	236320	236325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089093
4518	NC_003552	GAA	3	9	236334	236342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089093
4519	NC_003552	GAA	3	9	236350	236358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089093
4520	NC_003552	A	7	7	236443	236449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_003552	TCA	2	6	236506	236511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_003552	GATC	2	8	236580	236587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_003552	TCC	2	6	236606	236611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089094
4524	NC_003552	GT	3	6	236613	236618	0 %	50 %	50 %	0 %	20089094
4525	NC_003552	TGC	2	6	236689	236694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089094
4526	NC_003552	TTC	2	6	236728	236733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089094
4527	NC_003552	CCG	2	6	236735	236740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20089094
4528	NC_003552	A	6	6	236837	236842	100 %	0 %	0 %	0 %	20089094
4529	NC_003552	TA	3	6	236873	236878	50 %	50 %	0 %	0 %	20089094
4530	NC_003552	TA	3	6	236887	236892	50 %	50 %	0 %	0 %	20089094
4531	NC_003552	TCCTG	2	10	236933	236942	0 %	40 %	20 %	40 %	20089094
4532	NC_003552	TTC	2	6	237049	237054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089094
4533	NC_003552	TCA	2	6	237163	237168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089095
4534	NC_003552	TCA	2	6	237202	237207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089095
4535	NC_003552	TTTCA	2	10	237218	237227	20 %	60 %	0 %	20 %	20089095
4536	NC_003552	TTA	2	6	237237	237242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089095
4537	NC_003552	AAG	2	6	237251	237256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089095
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4539	NC_003552	T	6	6	237278	237283	0 %	100 %	0 %	0 %	20089095
4540	NC_003552	CAA	2	6	237298	237303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089095
4541	NC_003552	TAA	2	6	237355	237360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089095
4542	NC_003552	CT	3	6	237407	237412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_003552	ATA	2	6	237416	237421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_003552	CTA	2	6	237463	237468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_003552	TAA	2	6	237595	237600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_003552	CTT	2	6	237623	237628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_003552	CAG	2	6	237631	237636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_003552	TGA	2	6	237653	237658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_003552	T	6	6	237805	237810	0 %	100 %	0 %	0 %	20089096
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4552	NC_003552	TTC	2	6	237893	237898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089096
4553	NC_003552	CCAG	2	8	237932	237939	25 %	0 %	25 %	50 %	20089096
4554	NC_003552	TCCA	2	8	237947	237954	25 %	25 %	0 %	50 %	20089096
4555	NC_003552	CTT	2	6	238010	238015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089096
4556	NC_003552	TAT	2	6	238081	238086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089096
4557	NC_003552	TCGT	2	8	238120	238127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_003552	T	7	7	238284	238290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_003552	A	7	7	238293	238299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_003552	TAC	2	6	238331	238336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_003552	CA	4	8	238386	238393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_003552	ATGC	2	8	238407	238414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_003552	CATAG	2	10	238461	238470	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4564	NC_003552	CTT	2	6	238471	238476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_003552	TCA	2	6	238611	238616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089097
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4573	NC_003552	TTC	2	6	238904	238909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089097
4574	NC_003552	TGG	2	6	238913	238918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20089097
4575	NC_003552	TAT	2	6	239096	239101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089097
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4582	NC_003552	T	6	6	239390	239395	0 %	100 %	0 %	0 %	20089097
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4589	NC_003552	TGT	2	6	239600	239605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089097
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4591	NC_003552	T	6	6	239715	239720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_003552	A	8	8	239750	239757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_003552	CAA	2	6	239768	239773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_003552	TGA	2	6	239780	239785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_003552	TTA	2	6	239792	239797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_003552	A	7	7	239807	239813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_003552	TATT	2	8	239831	239838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_003552	TA	3	6	239846	239851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_003552	ATT	2	6	239869	239874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_003552	ATA	2	6	239931	239936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_003552	TA	3	6	240039	240044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_003552	AGC	2	6	240051	240056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_003552	ATTT	2	8	240075	240082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_003552	AAC	2	6	240160	240165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_003552	GAA	2	6	240266	240271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_003552	A	7	7	240282	240288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_003552	ATA	2	6	240318	240323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_003552	GTACC	2	10	240325	240334	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4609	NC_003552	AAT	2	6	240339	240344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_003552	A	6	6	240348	240353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_003552	CTGC	2	8	240429	240436	0 %	25 %	25 %	50 %	20089098
4612	NC_003552	TCA	2	6	240441	240446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089098
4613	NC_003552	TTC	2	6	240448	240453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089098
4614	NC_003552	TC	3	6	240464	240469	0 %	50 %	0 %	50 %	20089098
4615	NC_003552	T	6	6	240492	240497	0 %	100 %	0 %	0 %	20089098
4616	NC_003552	ACT	2	6	240521	240526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089098
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4619	NC_003552	GTTTT	2	10	240682	240691	0 %	80 %	20 %	0 %	20089098
4620	NC_003552	T	6	6	240741	240746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_003552	ATTA	2	8	240757	240764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_003552	A	6	6	240828	240833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_003552	GTT	2	6	240865	240870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_003552	AGGG	2	8	240889	240896	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4881	NC_003552	TC	3	6	253847	253852	0 %	50 %	0 %	50 %	20089107
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5000	NC_003552	CAT	2	6	260852	260857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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